MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 plasmid unnamed

Total Repeats: 464

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017345	CTAG	2	8	1648	1655	25 %	25 %	25 %	25 %	384868561
2	NC_017345	ATG	2	6	1657	1662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
3	NC_017345	TA	3	6	1718	1723	50 %	50 %	0 %	0 %	384868561
4	NC_017345	GAT	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
5	NC_017345	ATT	2	6	1827	1832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868561
6	NC_017345	TAA	2	6	1955	1960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
7	NC_017345	TAA	2	6	1967	1972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
8	NC_017345	ATAA	2	8	2051	2058	75 %	25 %	0 %	0 %	384868561
9	NC_017345	TAA	2	6	2107	2112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
10	NC_017345	GCTT	2	8	2113	2120	0 %	50 %	25 %	25 %	384868561
11	NC_017345	TTC	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868561
12	NC_017345	TTG	2	6	2180	2185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868561
13	NC_017345	ATG	2	6	2187	2192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
14	NC_017345	TC	3	6	2209	2214	0 %	50 %	0 %	50 %	384868561
15	NC_017345	AT	3	6	2225	2230	50 %	50 %	0 %	0 %	384868561
16	NC_017345	TAG	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
17	NC_017345	AAT	2	6	2309	2314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
18	NC_017345	GAA	2	6	2583	2588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
19	NC_017345	GTTG	2	8	2614	2621	0 %	50 %	50 %	0 %	384868562
20	NC_017345	CAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868562
21	NC_017345	A	6	6	2639	2644	100 %	0 %	0 %	0 %	384868562
22	NC_017345	CTAA	2	8	2685	2692	50 %	25 %	0 %	25 %	384868562
23	NC_017345	TTG	2	6	2737	2742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868562
24	NC_017345	TAA	2	6	2771	2776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868562
25	NC_017345	A	7	7	2840	2846	100 %	0 %	0 %	0 %	384868562
26	NC_017345	TA	3	6	2853	2858	50 %	50 %	0 %	0 %	384868562
27	NC_017345	AAG	2	6	2863	2868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
28	NC_017345	TGT	2	6	2915	2920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868562
29	NC_017345	T	6	6	3014	3019	0 %	100 %	0 %	0 %	384868562
30	NC_017345	TGACGA	2	12	3023	3034	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384868562
31	NC_017345	A	7	7	3034	3040	100 %	0 %	0 %	0 %	384868562
32	NC_017345	TGG	2	6	3098	3103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868562
33	NC_017345	TAATT	2	10	3155	3164	40 %	60 %	0 %	0 %	384868562
34	NC_017345	TGA	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868562
35	NC_017345	GAA	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
36	NC_017345	ATT	3	9	3247	3255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868562
37	NC_017345	T	6	6	3809	3814	0 %	100 %	0 %	0 %	384868563
38	NC_017345	TTTA	2	8	3824	3831	25 %	75 %	0 %	0 %	384868563
39	NC_017345	ATT	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868563
40	NC_017345	T	7	7	3853	3859	0 %	100 %	0 %	0 %	384868563
41	NC_017345	T	6	6	3864	3869	0 %	100 %	0 %	0 %	384868563
42	NC_017345	T	6	6	3927	3932	0 %	100 %	0 %	0 %	384868563
43	NC_017345	T	7	7	3936	3942	0 %	100 %	0 %	0 %	384868563
44	NC_017345	A	7	7	3966	3972	100 %	0 %	0 %	0 %	384868563
45	NC_017345	GAC	2	6	3977	3982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868563
46	NC_017345	T	6	6	4287	4292	0 %	100 %	0 %	0 %	384868564
47	NC_017345	TTTTC	2	10	4322	4331	0 %	80 %	0 %	20 %	384868564
48	NC_017345	TC	3	6	4330	4335	0 %	50 %	0 %	50 %	384868564
49	NC_017345	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868564
50	NC_017345	TAT	2	6	4379	4384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868564
51	NC_017345	TAG	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868564
52	NC_017345	TAT	2	6	4412	4417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868564
53	NC_017345	TTAGA	2	10	4448	4457	40 %	40 %	20 %	0 %	384868564
54	NC_017345	CT	3	6	4636	4641	0 %	50 %	0 %	50 %	384868565
55	NC_017345	TAA	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
56	NC_017345	AAT	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
57	NC_017345	TA	3	6	4710	4715	50 %	50 %	0 %	0 %	384868565
58	NC_017345	ATG	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868565
59	NC_017345	AC	3	6	4778	4783	50 %	0 %	0 %	50 %	384868565
60	NC_017345	TCT	2	6	4790	4795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868565
61	NC_017345	ATA	2	6	4806	4811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
62	NC_017345	TCT	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868565
63	NC_017345	T	6	6	4839	4844	0 %	100 %	0 %	0 %	384868565
64	NC_017345	ATC	2	6	4873	4878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868565
65	NC_017345	A	6	6	4883	4888	100 %	0 %	0 %	0 %	384868565
66	NC_017345	ATCAC	2	10	4925	4934	40 %	20 %	0 %	40 %	384868565
67	NC_017345	AAT	3	9	5014	5022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
68	NC_017345	TA	3	6	5038	5043	50 %	50 %	0 %	0 %	384868566
69	NC_017345	AAT	2	6	5044	5049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
70	NC_017345	CAA	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868566
71	NC_017345	AAG	2	6	5129	5134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868566
72	NC_017345	AAAATT	2	12	5135	5146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
73	NC_017345	AGTA	2	8	5161	5168	50 %	25 %	25 %	0 %	384868566
74	NC_017345	TTCA	2	8	5284	5291	25 %	50 %	0 %	25 %	384868566
75	NC_017345	T	6	6	5296	5301	0 %	100 %	0 %	0 %	384868566
76	NC_017345	CT	3	6	5304	5309	0 %	50 %	0 %	50 %	384868566
77	NC_017345	ATC	2	6	5323	5328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868566
78	NC_017345	ACTA	2	8	5428	5435	50 %	25 %	0 %	25 %	384868566
79	NC_017345	ATA	2	6	5444	5449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
80	NC_017345	A	6	6	5509	5514	100 %	0 %	0 %	0 %	384868566
81	NC_017345	TAA	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
82	NC_017345	TAA	2	6	5530	5535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
83	NC_017345	CTG	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868566
84	NC_017345	CAG	3	9	5562	5570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868566
85	NC_017345	CAA	2	6	5571	5576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868566
86	NC_017345	CATA	2	8	5587	5594	50 %	25 %	0 %	25 %	384868566
87	NC_017345	TTAT	2	8	5823	5830	25 %	75 %	0 %	0 %	384868567
88	NC_017345	A	6	6	5837	5842	100 %	0 %	0 %	0 %	384868567
89	NC_017345	AT	3	6	5854	5859	50 %	50 %	0 %	0 %	384868567
90	NC_017345	TC	3	6	5977	5982	0 %	50 %	0 %	50 %	384868567
91	NC_017345	A	6	6	5990	5995	100 %	0 %	0 %	0 %	384868567
92	NC_017345	TTA	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868567
93	NC_017345	AAAT	2	8	6126	6133	75 %	25 %	0 %	0 %	384868568
94	NC_017345	AT	3	6	6132	6137	50 %	50 %	0 %	0 %	384868568
95	NC_017345	CAAA	2	8	6148	6155	75 %	0 %	0 %	25 %	384868568
96	NC_017345	T	6	6	6180	6185	0 %	100 %	0 %	0 %	384868568
97	NC_017345	TTTAA	2	10	6295	6304	40 %	60 %	0 %	0 %	384868568
98	NC_017345	ATA	2	6	6532	6537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868569
99	NC_017345	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868569
100	NC_017345	TCA	2	6	6608	6613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868569
101	NC_017345	CCA	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868569
102	NC_017345	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868570
103	NC_017345	ATATT	2	10	6843	6852	40 %	60 %	0 %	0 %	384868570
104	NC_017345	TTC	2	6	6890	6895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868570
105	NC_017345	ATTGA	2	10	6933	6942	40 %	40 %	20 %	0 %	384868570
106	NC_017345	T	6	6	6983	6988	0 %	100 %	0 %	0 %	384868570
107	NC_017345	AAG	2	6	7000	7005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868570
108	NC_017345	T	7	7	7070	7076	0 %	100 %	0 %	0 %	384868570
109	NC_017345	TAA	2	6	7127	7132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868570
110	NC_017345	TTAG	2	8	7137	7144	25 %	50 %	25 %	0 %	384868570
111	NC_017345	ATC	2	6	7178	7183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868570
112	NC_017345	TCAT	2	8	7248	7255	25 %	50 %	0 %	25 %	384868570
113	NC_017345	ATT	2	6	7259	7264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868570
114	NC_017345	CTTC	2	8	7393	7400	0 %	50 %	0 %	50 %	384868570
115	NC_017345	TCT	2	6	7425	7430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868570
116	NC_017345	TTTA	2	8	7493	7500	25 %	75 %	0 %	0 %	384868570
117	NC_017345	CGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868570
118	NC_017345	T	7	7	7544	7550	0 %	100 %	0 %	0 %	384868570
119	NC_017345	CTTTT	2	10	7562	7571	0 %	80 %	0 %	20 %	384868570
120	NC_017345	T	6	6	7568	7573	0 %	100 %	0 %	0 %	384868570
121	NC_017345	TCA	2	6	7632	7637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868570
122	NC_017345	TTAG	2	8	7704	7711	25 %	50 %	25 %	0 %	384868570
123	NC_017345	TCTT	2	8	7760	7767	0 %	75 %	0 %	25 %	384868570
124	NC_017345	GAA	2	6	8254	8259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868571
125	NC_017345	TAA	2	6	8286	8291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868571
126	NC_017345	AGA	2	6	8346	8351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868571
127	NC_017345	A	6	6	8363	8368	100 %	0 %	0 %	0 %	384868571
128	NC_017345	TAC	2	6	8415	8420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868571
129	NC_017345	ACAA	2	8	8426	8433	75 %	0 %	0 %	25 %	384868571
130	NC_017345	A	7	7	8432	8438	100 %	0 %	0 %	0 %	384868571
131	NC_017345	ATA	2	6	8446	8451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868571
132	NC_017345	TAG	2	6	8482	8487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868571
133	NC_017345	AG	3	6	8627	8632	50 %	0 %	50 %	0 %	384868572
134	NC_017345	TAA	2	6	8633	8638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868572
135	NC_017345	AGAAAA	2	12	8666	8677	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384868572
136	NC_017345	CTA	2	6	8704	8709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868572
137	NC_017345	A	6	6	8737	8742	100 %	0 %	0 %	0 %	384868572
138	NC_017345	TAC	2	6	8747	8752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868572
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